細(xì)胞貼壁緊密程度：細(xì)胞貼壁緊密程度是影響消化時(shí)間的重要因素。像 HeLa 細(xì)胞這類貼壁相對(duì)緊密的細(xì)胞系，細(xì)胞與培養(yǎng)皿表面以及細(xì)胞之間的連接較為牢固。TrypLE Express 酶需要更多時(shí)間來(lái)裂解相關(guān)肽鍵，破壞細(xì)胞與底物的黏附，通常消化時(shí)間可能需要 5 - 10 分鐘，才能使細(xì)胞充分解離。而如 NIH/3T3 細(xì)胞，貼壁相對(duì)疏松，細(xì)胞與培養(yǎng)皿的結(jié)合力較弱，TrypLE Express 酶能夠更快地發(fā)揮作用，消化時(shí)間大概在 2 - 5 分鐘即可達(dá)到較好的解離效果 。

細(xì)胞外基質(zhì)成分：不同細(xì)胞系分泌的細(xì)胞外基質(zhì)成分和含量有別。某些細(xì)胞系會(huì)分泌較多的膠原蛋白、纖連蛋白等細(xì)胞外基質(zhì)成分，這些成分增強(qiáng)了細(xì)胞之間以及細(xì)胞與培養(yǎng)表面的相互作用。例如，在成纖維細(xì)胞系中，豐富的細(xì)胞外基質(zhì)使得細(xì)胞間連接緊密，TrypLE Express 酶需要更長(zhǎng)時(shí)間來(lái)分解這些基質(zhì)成分，消化時(shí)間可能長(zhǎng)達(dá) 8 - 10 分鐘。而一些上皮細(xì)胞系，細(xì)胞外基質(zhì)相對(duì)較少，消化時(shí)間則會(huì)相應(yīng)縮短 。

細(xì)胞的生長(zhǎng)狀態(tài)：處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞，細(xì)胞活力強(qiáng)，細(xì)胞膜和細(xì)胞骨架的結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定，對(duì)酶的耐受性較好，消化時(shí)可以適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間，以保證細(xì)胞充分解離，如對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的 CHO 細(xì)胞，消化時(shí)間在 5 - 7 分鐘較為合適。而處于生長(zhǎng)停滯期或老化的細(xì)胞，細(xì)胞結(jié)構(gòu)變得脆弱，對(duì)酶的作用更為敏感，消化時(shí)間需要縮短，一般 2 - 4 分鐘即可，否則過(guò)度消化會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞損傷甚至死亡 。

細(xì)胞系的特殊性質(zhì)：部分細(xì)胞系具有特殊性質(zhì)，也會(huì)影響消化時(shí)間。神經(jīng)細(xì)胞系，如 PC12 細(xì)胞，細(xì)胞形態(tài)特殊，有較多細(xì)長(zhǎng)的突起，這些突起容易在消化過(guò)程中受損。因此，在使用 TrypLE Express 酶時(shí)，需要縮短消化時(shí)間，控制在 2 - 3 分鐘左右，并且要在顯微鏡下密切觀察細(xì)胞狀態(tài)，一旦細(xì)胞開(kāi)始變圓，就要及時(shí)終止消化，以保護(hù)細(xì)胞結(jié)構(gòu)的完整性 。